ספטמבר היה חם מהממוצע בכמעלה וירדו בו כמויות גשם גדולות יחסית לחודש זה בעיקר בצפון הארץ. הגשמים ירדו בחלקו השני של החודש, בשני אירועים נפרדים, וביחד עם אירועי הגשם של אוגוסט היו מתחילת העונה כבר ארבעה אירועי גשם – מצב נדיר לשלב מוקדם זה של עונת הגשם. בחלק מהתחנות בצפון הארץ ירדו בספטמבר 10 עד 15 מ"מ ואף יותר לעומת ממוצע של כ-3 עד 5 מ"מ ובתחנות רבות באזור היו ארבעה ימי גשם בחודש כשבאזור נהריה אף היו חמישה ימים. כמויות הגשם הללו ומספר ימי הגשם הרב בצפון הארץ אינם דבר שכיח בספטמבר, אם כי תדירות המקרים גדלה בעשורים האחרונים.

עד מעט אחרי אמצע ספטמבר נמשכה המגמה שהחלה באמצע יולי של טמפרטורות גבוהות מהרגיל ובחלק מהימים אף היו טמפרטורות גבוהות מהממוצע במידה ניכרת. לעומת זאת בחלקו השני של החודש היתה התקררות עם טמפרטורות קרובות לממוצע ובסוף החודש אף נמוכות ממנו.

ברמה כלל ארצית ספטמבר היה חם מהממוצע ב-0.8 מ"צ והוא מדורג שביעי בהשוואה לעבר. הוא חם מעט יותר מחודשי ספטמבר בשנתיים הקודמות, אך פחות מספטמבר 2023. קיץ 2026 (יוני עד ספטמבר) היה חם מהממוצע, אולם לא במידה ניכרת, כיוון שחלקו הראשון (עד אמצע יולי) היה מתון וכך גם חלקו האחרון.